En 1999, Stéphan Jourdain mettait la main sur ce site touristique pour la somme de 1,75 million d’euros. Il ne les a toutefois pas sortis entièrement de sa poche puisqu’il a bénéficié de 1,1 million de primes à l’investissement pour ce site classé patrimoine majeur de Wallonie.
En 2004, Stéphan Jourdain revend pour 3,5 millions d’euros 25ha du Jardin à la Région wallonne qui lui octroie alors un bail emphytéotique de 99 ans. Stéphan Jourdain passe alors châtelain locataire mais acquiert 20ha de bois et prairies. Des actifs qu’il a revendus à Ernest Loumaye, un investisseur belge, établi en Suisse qui a fait sa carrière dans le secteur pharmaceutique.
En mars 2007, les Jardins d’Annevoie affichent 800.000 euros de dettes, dont près de 194 .000 € de TVA selon la Libre : malgré une fréquentation dépassant 50.000 unités, l’ASBL enregistre un déficit d’exploitation annuel de 200 à 225 0